Il museo è stato realizzato nel 2003 e rinnovato nel 2022, ospitato all’interno della vecchia sede del Municipio della città, in un edificio risalente probabilmente al XVI secolo.
Descrive il territorio di età romana dell'antica città di Pitinum Mergens - sito individuato, ma mai scavato, in località Pole-Pian di Valeria – e, in particolare, svela la vita quotidiana di una villa romana repubblicana, rinvenuta a pochi km dal centro storico, scavata dall'Università di Urbino tra il 1995 e il 1997, in loc. Colombara.
La fattoria romana di Colombara, che prende nome da una torre per allevare i colombi, rappresenta un caso molto fortunato di recupero di materiali perché, sigillati sotto il crollo generato da un incendio, ci sono arrivati tanti oggetti intatti: strumenti per la filatura, attrezzi agricoli, lucerne, vasi da mensa, alcuni dei quali addirittura mostrano al loro interno ancora i cibi carbonizzati.